Es el único servicio de compensación, liquidación y custodia en Uruguay. En el año 1992 la Bolsa de Valores comenzó a compensar y liquidar los efectivos de las operaciones realizadas por sus operadores, en el año 1998 buscando dar mayor seguridad a la liquidación de operaciones la Bolsa de Valores pasó a compensar tanto el efectivo como los valores involucrados en las transacciones bursátiles.

La liquidación se realiza a través de neteo multilateral basándose en el principio de entrega contra pago, esto es, no se entrega ningún valor si el comprador no ha cumplido con sus obligaciones así como tampoco se abonan valores sin que éstos hayan sido entregados a la Bolsa de Valores a través de diferentes instituciones bancarias. Este mecanismo da garantía a las partes del buen fin de las operaciones, es de destacar que en la historia de la Bolsa de Valores no se han producido incumplimientos por liquidación de operaciones.

En la Bolsa de Valores de Montevideo operan, tanto sus socios activos como especiales. Los primeros, que poseen todos los derechos políticos, son los Corredores de Bolsa, tanto personas físicas como jurídicas (Sociedades de Bolsa). Los segundos, son instituciones de intermediación financiera (Bancos) y la Caja de Jubilaciones y Pensiones Bancarias y la Caja Notarial de Jubilaciones y Pensiones.

Antares Sociedad de Bolsa S.A Axion Sociedad de Bolsa S.A Bado, José Luis Baeremaecker Barros, Carlos De Bargo Tanco, Germán Bonnet Buela, Carlos Alberto Carriquiry Urrestarazu, Eduardo Alvaro Caumont, Jorge Chiarino Rossi, Gustavo Comas, Carlos César Comas Saavedra, Eduardo Compañía de Valores Pérez Marexiano Sociedad de Bolsa S.A. Continental Sociedad de Bolsa S.A. Corinvest Sociedad de Bolsa S.A. Corporación de Inversiones Uruguay Sociedad de Bolsa S.A. Costa Lema, Eduardo Cukier Goldring, Marcos Jacobo Custodia de Valores Mobiliarios Sociedad de Bolsa S.A. Damiani, Juan Pedro De Simoni & Piaggio Sociedad de Bolsa S.A. Di Matteo Mondino Sociedad de Bolsa S.A. Duran y Perera Sociedad de Bolsa S.A. Elgue Carámbula, Raúl Tabaré Europa Sociedad de Bolsa S.A. Fénix Trading Sociedad de Bolsa S.A. Ficus Capital Sociedad de Bolsa S.A. Freda Ferrari, Jorge Donato Galfin Sociedad de Bolsa S.A. Gastón Bengochea y Cia. Sociedad de Bolsa S.A. Giordano e Hijos Sociedad de Bolsa S.A. Grupo Bursátil Uruguayo Sociedad de Bolsa S.A. GT Sociedad de Bolsa S.A. Hordeñana & Asociados Sociedad de Bolsa S.A. Interbaltic Sociedad de Bolsa S.A. Intervalores Sociedad de Bolsa S.A. Inversiones Ruben Noya Sociedad de Bolsa S.A. Jorge Davison & Cia. Sociedad de Bolsa S.A. Juan Francisco Marin y Asociados Sociedad de Bolsa S.A. Konrad Quintero, Pedro Andrés Levy y Asociados Sociedad de Bolsa S.A. Maiorano & Cia. Sociedad de Bolsa S.A. Merfin Sociedad de Bolsa S.A. Mervalsur Sociedad de Bolsa S.A. Montaldo Sociedad de Bolsa S.A. Montevideo Bursátil Sociedad de Bolsa S.A. Mumoli Coaik, Adriana Openworld Sociedad de Bolsa S.A. Pampa Brokers Sociedad de Bolsa S.A. Paullier Pereira, Matías. Paullier Pereira, Victor Paullier Symonds, Marcel Pérez Montero, Daniel Edgardo Pérez, Pedro César Pollio Hnos. Sociedad de Bolsa S.A. Pollio y Cia. Sociedad de Bolsa S.A. Probursa Sociedad de Bolsa S.A. P.T. BEX Bursátil Sociedad de Bolsa S.A. Puente Hnos. Sociedad de Bolsa S.A. Rebagliatti Morixe Sociedad de Bolsa S.A. Rebella Altieri, Rodolfo Renmax Sociedad de Bolsa S.A.